Nach der Änderung des Projektes von „Debug|x86“ zu „Debug“ (AnyCPU) meldete sich MonoDevelop mit der Meldung:
invalid configuration mapping
Das Problem liegt hier aber nicht am Projekt selbst, sondern an der Projektmappe (Solution).
Die fehlerhaften Einstellungen in der Projektmappe
Diese erreicht man indem man auf die Wurzel der Mappe klickt und dort den Punkt „Optionen“ auswählt. Unter „Erstellen“ -> „Konfigurationen“ findet man dann den Übeltäter. Hier erstellt man neue Konfigurationen und entfernt die alten. Danach sollte es mit dem umgestellten Projekt keinerlei Probleme mehr geben.